Sur la partie herbacée, le Pied noir s’exprime au niveau des organes aériens soit par une absence de débourrement, soit par la présence d’une végétation affaiblie pouvant aller jusqu'à l'apoplexie.

Au niveau du système racinaire des plantes touchées par le Pied Noir on constate des racines peu profondes, d'apparence nécrosées qui se développent parallèlement à la surface du sol. Il est possible d'observer un deuxième plateau de racine au niveau du porte-greffe qui permet la survie de la jeune plante.

Dans le bois, on observe un nécrose noire qui part du talon et remonte dans le porte-greffe. En coupe transversale, la nécrose commence de l’écorce et gagne l’intérieur des tissus ligneux, elle peut se développer jusqu’au niveau de la moelle.